لشرب القهوة دور في إزالة السموم من الكبد و بعض الأشخاص يشعرون بالتعب، وهذا شئ يظهر في صورة قلق ونرفزة أوصعوبة في النوم و مشاكل في الهضم.أما اذا كنت تعاني من مشاكل في الغدة الدرقية التهاب الدرقية الهاشيموتي أو الأرق والقلق أو ظروف مرتبطة بالهرمونات. من المهم أن تكون واعي بدرجة كبيرة للاًثار الجانبية لشرب القهوة لأن القهوة تزيد من مستوي السكر في الدم وهذا أمر في منتهي الخطورة علي الأشخاص الذين يعانون من نقص السكر في الدم أو مستوي سكر منخفض،الذي يرهق الغدة الفوق كلوية و يؤثر علي الجهاز المناعي . نتيجة لما تسبب القهوة بزيادة في مستويات السكر في الدم، عندما تنخفض مستوي السكر في الدم ,فأنت تكون بحاجة إلي رفع مستوي السكر مرة ثانية. وهذا هو السبب لماذا بعض الناس عندما يشربوا القهوة علي الأفطار، يشعروا بالجوع بشكل سريع كما القهوة أن تحفز أطلاق الجيسترين (هرمون المعدة الرئيسي)، الذي يسرع وقت النقل المعوي. القهوة ايضاً تحفز أطلاق المادة الصفراء، و تحفز القهوة ايضاً الأنزيمات الهاضمة.القهوة تؤثر علي الدورة الشهرية و تتسبب في الثدي المتكتل تساهم في هيمنة هرمون الأستروجين، مما يعني أحد الأمرين : إما الحصول علي كمية كبيرة من الأستروجين أو حدوث عم توازن أو خلل في التمثيل الغذائي للأستروجين ( بعضها واقي و الأخر خطير). الدورة الشهرية و الثدي المتكتل و النزيف و السيلوليت و سرطان الثدي قد يكونوا أعراض لهيمنة هرمون الأستروجين
القهوة تسبب الأرق و صعوبة في النوم وهذا يعتمد ويختلف من شخص لأخر حسب القدرة علي استقبال الكافيين. بعض الناس يناموا بشكل عميق ومريح جداً سواء تناولوا القهوة أم لا, بينما البعض الأخر لا يستطيعوا النوم حتي لو لم يتناولوا أي شئ يحتوي علي الكافيين منذ فترة الظهر.